İl sınırları içerisinde deniz kirliliğinin önlenmesi amacıyla Karadeniz'den Ambarlı açıklarına kadar deniz havadan ve denizden denetleniyor. Çevre Koruma Müdürlüğü ekipleri, katı atık ve evsel atık deşarjı, kirli balast, petrol türevi, sintine basılması, tehlikeli madde ve kimyasallarla denizin kirletilmesini önlemek amacıyla 4 adet kontrol botu ile denetimlerini 24 saat aralıksız sürdürülüyor. Bu botların 2'si ile 24 saat aralıksız denizde denetimler devam ettirilirken, 2 bot ise acil durum şikayetlerini değerlendirmek üzere hazır olarak bekletiliyor. Deniz kirliliği ile etkin mücadele edebilmek amacıyla 26 Aralık 2006 tarihinden itibaren havadan helikopterle de denetimlere başlayan İstanbul Büyükşehir Belediyesi, yapılan bu denetimlerde tespit ettiği olumsuzlukları bölgede görev yapan deniz kontrol ekiplerine iletiyor. Kirleten ödediÇevre ve Orman Bakanlığı'nın Yetki Devri Genelgesi ile İstanbul deniz sınırları içinde denetim yetkisini kullanan İstanbul Büyükşehir Belediyesi ekipleri, 2007 yılı içerisinde yapılan denetimler sonucu, denizi kirlettiği tespit edilen 79'u Türk, 259'u yabancı bandıralı toplam 338 adet deniz aracına, toplam 9 milyon 763 bin 834 YTL idari para cezası verdi. Belediye ekipleri, bu yılın ilk 16 gününde de denizi kirlettiği tespit edilen 5 deniz aracına toplam 94 bin 360 YTL para cezası uyguladı. Çevre Koruma Müdürlüğü verilerine göre; son 20 yılda (1988-2007) denizi kirleten 428'i Türk, 900'ü yabancı bandıralı toplam bin 328 gemiye toplam 28 milyon 328 bin 326 YTL para cezası kesildi.