Yunanistan'ın başkenti Atina'daki Megaron Konser Salonu'nda gerçekleştirilen kura çekiminde Efes Pilsen A Grubu'nda Ta Ceramica, Olympiakos, Bologna, Brokomi, Trefl, Dinamo Moskova, Le Mans, Rhein energie ile eşleşirken Fenerbahçe Ülker'in ise C Grubu'nda CSKA Moskova, Barcelona, Benetton Treviso, Zalgiris Kaunas, Pau qartez, Aris, Basket Napoli ile mücadele edecek. Kura çekiminde 8 torbada bulunan toplam 24 takım, 2005-06 sezonundaki performanslarına göre sıralandı. Efes Pilsen 3. torbada Fenerbahçe Ülker ise 4. torbada kura çekimlerine katıldı.
Eşleşmeler şöyle oldu:A GrubuTau Ceramica, Olympiakos, Efes Pilsen, Bologna, Prokom Trefl, Dinamo Moskova, Le Mans, Rhein EnergieB GrubuMaccabi Tel Aviv, Panatiniakos, Unicaja, Cibona Zagreb, Union Olimpija, Partizan, Lokomatica Roma, Joventut BadalonaC GrubuCSKA Moskova, Barcelona, Benetton Treviso, Fenerbahçe Ülker, Zalgiris Kaunas, Pau Qartez, Aris, Basket NapoliBeşiktaş'ın kupadaki rakipleri belli olduBasketbolda ULEB Kupası'nda 2006-2007 sezonu grup maçlarının kuraları da çekildi. Yunanistan'ın başkenti Atina'da yapılan kura çekimiyle, bu kupadaki Türk temsilcisi Beşiktaş'ın da grubundaki rakipleri belli oldu. Siyah-beyazlı takım, (B) Grubu'nda Sırbistan'ın BC FMP Zeleznik, Letonya'nın BK Ventspils, İtalya'nın Snaidero Basket Udine, Polonya'nın Anwil Wloclawek ve Fransa'nın SIG Strasbourg takımlarıya eşleşti.15 ülkeden toplam 24 takımın katıldığı kupada, 4 grupta 6'şar takım yer alacak. Grup karşılaşmaları, 30 Ekim 2006-16 Ocak 2007 tarihleri arasında çift devreli lig usulüne göre oynanacak. Gruplarında ilk 4 sırayı alan toplam 16 ekip bir üst tura yükselecek ve bundan sonraki turlar çift maçlı eleminasyon sistemine göre yapılacak.Kupada finale kalan takımlar, 10 Nisan 2007 tarihinde Belçika'nın Charleroi kentinde finalde şampiyonluk için karşılaşacak.